• [Project G]昨日制限酵素処理したプラスミドを電気泳動
  • [Project T]昨日からの解析の続き。昨日は反復配列のファミリーから2つの参照配列を選び、ファミリー内の各配列がそのどちらに似ているかをalignを使って調べた。今日はその結果をもとにして、ファミリーを(1)配列1に似ているもの、(2)配列2に似ているもの、(3)どちらにもあまり似ていないもの、の3グループに分割し、それぞれから20配列をランダムにサンプリングして、clustalwでアラインメントさせた。結果を眺めてみると、やはり明瞭ないくつかのサブファミリーに分かれたので、それらのさびファミリーを特徴づける末端配列を抜き出して、正規表現検索をかけた。これでサブファミリー内をほぼ均一化できたら良いのだけれど。今日のところはこれで時間切れ。