• 10日も日記の空白があいてしまった。この間にやっていたのは主にGプロジェクトのPCRの条件設定と、TプロジェクトとGプロジェクトの解析プログラムの練り直し。PCRの方は最初の3回くらい、まったくバンドが見えなくて、プライマーを疑ってしまったが、条件を調節したらようやくバンドが出るようになった。しかし予想よりもTmがずいぶん低い感じ。クローニングしてシーケンスするまでは不安である。
  • プログラムの方は、いままでの解析結果に基づいて全体の流れをもう一度再検討しなおして、スクリプトを書き直している。一番の問題は配列のクラスタリングのところで、1万配列を越えるくらいの数をblastclustでクラスタリングしようとすると、大学のMacではメモリ不足でエラーが出てしまう。自宅のiMacG5は1GBのメモリを積んでいるのでなんとか処理ができるのだが。やっぱり研究室にはPowerMac G5クラスが欲しい。