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• [Project T]昨夜、自宅のMacで走らせていた解析が何故か途中で頓挫していたので、続きを大学のMacで走らせる。平行して、この解析の副産物データを使って、反復配列ファミリーのdiversityを評価する方法を考える。ある反復配列のファミリーの中に、複数のサブファミリーがあって、それぞれのサブファミリーに数百から数万のコピーが含まれている。このとき、それぞれのサブファミリーのコピー配列の多様性（あるいは均一性）をどのように評価したら良いか。一見して、このサブファミリーのメンバーはけっこうバラバラだよな、とか、このサブファミリーは結構均一に見えるけど、さらにおおまかに２つか３つのサブサブファミリーに分かれそうな感じがするよな、とかいう印象は受けるのだが、さて、それをどのように解析して表現すれば良いのだろう？　いろいろアイディアを考えてスクリプトを書いて試してみる。

• [Project G]シークエンスの続きを粛々と。