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• [Project T]きのう分類した塩基配列の各サブグループがどのくらい均一か調べる。サブグループの中からもっとも典型的な配列の一つを選んできて、その配列と他のサブグループメンバーとのグローバルアラインメントスコアを計算する。その結果を、配列の長さを横軸に、スコアを縦軸にとって、Rでグラフ化する。Rを久しぶりに使ったけど、だいぶ慣れてきたようで、わりとスムーズに使い方を思い出せた。結果はまあ予想通り。いくつかのサブグループは、さらにサブサブグループに分けないといけないので、その方法を検討する。続きは明日。